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ハイドロカルチャーにて育てているポリシャスの根っこの部分に緑色のコケみたいなものがついていますが、これはとっちゃったほうが、いいのでしょうか？

挿し木床（オアシス等）ではないとしたら、藻類だと思います。
カビのように強烈なにおいがするなら、たぶん藍藻です。
今の時期、最低気温15℃を保てないようなら、植え替え等は禁物です。
表面に出ている部分で、簡単に取り除けるなら取ってしまって大丈夫ですが。
あまり実害はないと思うので、そのままにして置くのがいいでしょう。

気になるようなら、５月くらいに植え替えるといいですね。
ハイドロボールを熱湯消毒したり、新しいものを用います。
根に付いているなら、根を傷めないように洗い流します。

あるいは、黒い紙で緑色の部分を覆っておくと、光合成できないで消えてしまうこともあります。
ただ、根絶は難しいこともあるのですが。